在药物研发的早期阶段，通过生物学研究确定药物靶标之后，一个亟需回答的问题是：如何从靶标结构出发，发现或设计出一类小分子化合物与之结合从而改变其生物学活性？近几年，随着计算机辅助药物设计技术的快速发展，虚拟筛选成为了解决这个问题的重要技术手段。
虚拟筛选（Virtual Screening , VS）是指基于药物设计理论，借助计算机技术和计算化学软件，从大量化合物中挑选出一些苗头化合物，进行生物活性实验测试的一种方法，其目的是从几十个乃至百万个分子中筛选出新的先导化合物。
虚拟筛选分为基于受体和基于配体两类，康昱盛提供一整套完美的虚拟筛选解决方案，从小分子数据库准备、受体结构准备到多种手段的迭代筛选，再到ADMET性质评估、化合物多样性分析，到最后手动挑选潜在的活性化合物，进行下一步生物活性测试，每一步都采用了主流的计算化学方法，基于康昱盛MOE药物设计平台、StarDrop和Derek等ADMET分析工具，提高筛选命中率。
虚拟筛选的一般流程
虚拟筛选的主要技术手段
主要技术概述：
1. 小分子数据库准备：基于主流的小分子化合物数据库ZINC、Specs、Enamine、ChEMBL、BindingDB等，对化合物采用MOE的Wash模块进行准备；
2. 蛋白结构准备：对已知晶体结构的靶点，直接从RCSB PDB数据库下载；对靶点未知3D结构的，可采用同源模建技术模建蛋白结构；
3. MOE提供药效团、分子对接、QSAR等多种策略，对化合物库进行迭代筛选，基于分子对接的筛选还可以考虑刚性和柔性对接，具有多种打分函数进行评价；
4. ADMET性质评估：对完成初筛的化合物，可以基于StarDrop、Derek进行化合物成药性分析以及毒性评估，早期筛除可能导致研发失败的化合物；
5. Cluster分析和多样性分析：对最后各项属性均衡的潜在活性化合物，可以通过聚类和多样性分析，挑选母核（骨架）不同的苗头化合物，进行生物活性测试，避免重复的骨架导致资源浪费，提高后期改造的成功率。
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