2021-09-15
StarDrop小分子药物设计软件在本周发布全新7.1版本。StarDrop 7.1为用户带来全新的Surflex eSim3D模块，更好地帮助用户进行基于小分子三维结构的药物设计。
全新的Surflex eSim3D模块支持用户进行基于配体三维结构的小分子药物设计。无需获悉受体蛋白结构，用户即可利用已有的活性小分子进行3D虚拟筛选。通过先进的小分子构象预测算法[1]，用户可以从构象上了解3D构效关系，用于小分子结构优化。 StarDrop小分子药物设计软件在本周发布全新7.1版本。StarDrop 7.1为用户带来全新的Surflex eSim3D模块，更好地帮助用户进行基于小分子三维结构的药物设计。
Surflex eSim3D模块可以从晶体结构文件、低势能构象或多配体结合模型中，获取参考配体，进行构象叠合。通过显示关键的分子形状、电势属性及氢键，用户可以获取影响结合的关键相互作用，并查看不同分子的形状相似性和差异。
Surflex eSim3D模块可以从基于结合结果输出相似性打分，用于识别活性化合物及骨架跃迁，并进行大规模虚拟筛选。
通过将多个活性小分子叠合，Surflex eSim3D可以为用户构建多配体结合模型。即使受体结构未知，用户也可以从中分析可能的结合口袋形状、电性特征等。此外，多配体结合模型可以帮助鉴别对活性至关重要的关键相互作用。
[1] Cleves et al. J. Comput. Aided Mol. Des. (2019) 33 (10) pp. 865 886;
Cleves et al. J. Chem. Inf. Model. (2020) 60 (9) pp. 4296 4310;
Cleves and Jain J. Comput Aided Mol. Des. (2017) 31 (5) pp. 419 439
